Incidence de la coqueluche grave et non sévère chez les nourrissons zambiens exposés et exposés au VIH pendant les semaines d’âge: résultats de l’étude sur la coqueluche infantile mère d’Afrique australe SAMIPS, une étude longitudinale de cohorte de naiss

ContexteVaccin interne contre le tétanos, la diphtérie à dose réduite et le vaccin anticoquelucheux acellulaire Le dcaT pourrait être un moyen efficace d’atténuer le fardeau résiduel élevé de la morbidité et de la mortalité infantiles causées par Bordetella pertussis Pour mieux éclairer ces interventions, nous avons mené une étude sur le fardeau de la maladie. Méthodes: Les paires mère-nourrisson ont été recrutées à la semaine de la vie, puis observées toutes les semaines à des semaines d’âge. À chaque visite, des prélèvements naso-pharyngiens ont été réalisés à la fois chez les nourrissons et chez les nourrissons. Nous avons calculé l’incidence de la maladie en utilisant le temps de personne à risque comme dénominateur. Résultats d’une population de nourrissons, nous avons identifié avec la coqueluche clinique, pour une incidence globale de cas% intervalle de confiance [IC], – par mois-nourrisson et un cumul Neuf cas survenus au cours d’une fenêtre de mois de mai à juillet, avec l’incidence la plus élevée entre les cas de naissance et les semaines d’âge par mois de nourrisson, concentrée chez les nourrissons avant la vaccination ou parmi ceux qui n’avaient que dose reçue de Diphtérie Tétanos cellules entières Pertussis DTwP Virus de l’immunodéficience humaine maternelle Le VIH a légèrement augmenté le risque de risque de coqueluche infantile, [% CI, -] Seulement des cas infantiles qualifiés de sévère coqueluche Le reste présenté avec les symptômes légers et non spécifiques de la toux , coryza, et / ou tachypnée Notamment, les durées de la toux étaient longues, dépassant plusieurs jours, avec des PCR à répétition positives au fil du temps. ConclusionsCertains circulent librement parmi cette population de nourrissons zambiens mais présentent rarement les symptômes classiques de toux paroxystique, de coqueluche, d’apnée, et cyanose Le VIH maternel semble augmenter le risque, tandis que l’absence d’exposition efficace au DTwP augmente le risque

Coqueluche, Bordetella pertussis, incidence, étude de cohorte, surveillance prospectiveBordetella pertussis, agent de la coqueluche, infecte des millions d’enfants dans le monde et tue des centaines de milliers de personnes La coqueluche est l’une des maladies contagieuses les plus contagieuses et la moins Prévention de toutes les maladies infantiles évitables par la vaccination Les cas graves et mortels sont concentrés chez les très jeunes enfants entre la naissance et les premiers mois , avant le début de la vaccination des nourrissons et avant que les nourrissons puissent développer une immunité endogène efficace. ce problème en accélérant le début de la série vaccinale infantile a été décevant, en raison principalement de l’immaturité du système immunitaire infantile. Les déficits les plus profonds sont les réponses humorales, se manifestant par une réponse immunitaire atténuée ou absente aux vaccins, , persistance plus courte des réponses et anticorps de plus faible affinité Pour e Par exemple, dans une étude évaluant l’immunogénicité de la coqueluche à la naissance, les nouveau-nés ont non seulement démontré des réponses médiocres à la dose à la naissance, mais aussi des réponses atténuées aux vaccins anticoquelucheux. , la stratégie d’administration du vaccin de rappel aux adolescents Tdap tétanos, diphtérie à dose réduite, coqueluche acellulaire aux mères pendant la grossesse pour augmenter le transfert passif des anticorps anticoquelucheux maternels in utero a attiré beaucoup d’attention Une récente étude observationnelle de la Tdap maternelle au Royaume-Uni a montré une Cependant, le coût élevé des vaccins Tdap disponibles dans le commerce les rend inabordables pour les pays à revenu faible et intermédiaire scarlatine. Les pays à faible revenu et à revenu intermédiaire (PRITI) ont suscité un vif intérêt. développement d’un vaccin anticoquelucheux plus abordable, adapté à un vaccin maternel En préparant la voie pour le développement d’un tel vaccin, le Bill & amp; La Fondation Melinda Gates a commandé un trio d’études sur le fardeau de la maladie pour déterminer l’incidence de la coqueluche grave et non sévère dans les PRFI Les pays sélectionnés étaient la prévalence élevée du virus de l’immunodéficience humaine en Zambie et l’utilisation continue du vaccin anticoquelucheux. La prévalence du VIH au Pakistan est faible, mais la prévalence du VIH est élevée en Afrique du Sud, mais récemment, elle est passée au vaccin anticoquelucheux acellulaire [aP] Cet article résume les conclusions de l’étude sud-africaine sur la coqueluche infantile SAMIPS en Zambie et répond aux questions suivantes : Quelle est l’incidence de la coqueluche sévère et non sévère chez les nourrissons zambiens Quels facteurs expliquent les différences d’incidence et Quelle est la symptomatologie clinique associée à ces cas?

Méthodes

Vue d’ensemble de SAMIPS

Pour assurer la cohérence méthodologique, le site de Zambie a harmonisé sa définition de cas de dépistage, ses procédures de prélèvement nasopharyngien, ses processus de PCR et ses systèmes de notation de sévérité de la coqueluche avec les sites Pakistan et Sud-Africains. une cohorte de naissance longitudinale La population étudiée SAMIPS était constituée de couples mère-nourrisson du complexe de Chawama, un grand bidonville périurbain informel situé au sud-ouest du centre-ville de Lusaka. Le complexe de Chawama mesure environ km et abrite une population d’environ La clinique PHC est la seule clinique soutenue par le gouvernement dans l’enceinte de Chawama et la source prédominante pour tous les soins médicaux dans cette communauté Logement notre étude à la Chawama PHC nous a mis au centre de presque tous les soins primaires dans le compound et l’excellence dans l’éthique de la recherche et la convergence des sciences à Lusa ka a fourni conjointement une supervision éthique Toutes les mères ont fourni le consentement éclairé écrit, avec des formulaires de consentement présentés en anglais et les langues vernaculaires dominantes parlées à Lusaka: Bemba et Nyanja Comme c’était une étude observationnelle, elle n’avait pas besoin d’être enregistrée à ClinicalTrialsgov qui ont signé le consentement et accepté toutes les procédures, qui resteront dans le bassin versant de Chawama pour les mois à venir, et nous ont donné accès aux dossiers documentant leur statut sérologique Pour réduire au minimum l’attrition liée à la mortalité dans cette cohorte longitudinale, les nourrissons en bonne santé, n’étaient pas prématurés & lt; semaines de gestation ou insuffisance pondérale & lt; Les couples mères-nourrissons ont été inscrits lors de la première visite de l’enfant après l’accouchement. Des données de base ont été recueillies sur la mère et le nourrisson, y compris le statut sérologique maternel et le VIH. CD compte si disponible, âge maternel, composition du ménage, poids à la naissance, âge gestationnel et autres facteurs L’étude n’a pas mesuré le nombre de CD pour les mères infectées par le VIH, mais uniquement les données déjà disponibles à la clinique VIH de Chawama. Le dépistage maternel de la coqueluche n’a pas pu être déterminé étant donné l’absence de tels enregistrements et étant donné que le fait de demander aux mères de se souvenir de leur statut de vaccination infantile était irréaliste alors qu’elles auraient pu donner des réponses, il y aurait aucun moyen de les vérifier, et nous avions peu de confiance que les sujets pouvaient raisonnablement s’attendre à connaître la réponse. Il n’était pas pratique de obtenir des échantillons sanguins de base de toutes les mères pour permettre des analyses sérologiques rétrospectives autour du sous-groupe de nourrissons qui pourraient développer ultérieurement la coqueluche. À la base et par la suite, les deux membres de la paire mère-nourrisson ont subi un échantillonnage NP. une liste de contrôle normalisée pour caractériser le sujet à chaque point d’échantillonnage Le but de planifier les visites et d’obtenir des échantillons sans tenir compte des symptômes était de minimiser les biais d’échantillonnage. Les visites ad hoc entraînaient également des écouvillonnages NP des deux membres de la paire. plaintes chez la mère ou chez le nourrisson Les données cliniques et l’échantillonnage NP ont été effectués par des membres de l’équipe d’étude SAMIPS soit une infirmière autorisée, soit un agent clinique. Les nourrissons ont reçu des vaccins programmés à, et des semaines avec le vaccin pentavalent diphtérie / tétanos / coqueluche à cellules entières. conjugué influenzae de type b, et l’hépatite B Pentavac, Institut du sérum de l’Inde Lim Le vaccin antipneumococcique valide, le vaccin antirotavirus oral et le vaccin antipoliomyélitique oral, le vaccin oral contre le poliovirus, et une première dose de VPO sont administrés à la naissance, mais cela s’est produit avant l’enrôlement.

Contrôle de qualité de l’échantillon et de la collecte de données

La fidélité de l’identification de l’échantillon reposait sur des codes à barres pour identifier de manière unique les sujets et les données liées aux codes à barres pour identifier les échantillons de manière unique. Les codes à barres du sujet et de l’échantillon étaient scannés au moment du prélèvement. pour capturer des données par voie électronique Pour chaque paire mère-nourrisson, nous avons imprimé des étiquettes d’identification de sujet, composées d’étiquettes à code-barres identiques par sujet, imprimées en rose comme XXXX- pour les mères et moitié en vert comme série XXXX- pour les nourrissons, et apposées Les échantillons ont été étiquetés à l’aide d’un ensemble de codes à barres d’identification d’échantillon uniques, imprimés en double exemplaire: copie pour le rapport de cas avec données sur les symptômes et la seconde pour le tube échantillon. dates enregistrées numériquement, et accouplé ceux-ci aux données de symptômes de chaque individu

Procédures de laboratoire

Des prélèvements de NP ont été réalisés en utilisant des tampons de nylon floqués Copan Diagnostics, Merrieta, Californie, pour adultes ou nourrissons, selon les indications. Dans des études comparatives standardisées comparées à des prélèvements NP de comparaison, des tampons de nylon floqués ont donné un taux de culture plus élevé. Les écouvillons ont été insérés dans les deux narines jusqu’à ce qu’ils entrent en contact avec le nasopharynx postérieur et aient subi des rotations dans les deux directions. Les écouvillons ont ensuite été placés dans des tubes préparés commercialement avec des densités unitaires. UTM et stockés sur glace jusqu’au transport Les échantillons ont été prélevés chaque jour dans la clinique d’étude et transférés au laboratoire de PCR du CHU UTH et stockés à – ° C jusqu’au test PCR. Nos analyses primaires ont été réalisées à l’aide de l’algorithme de diagnostic et validée par le groupe des pathogènes respiratoires aux US Centers for Disease Contro L’ADN a été extrait à l’aide du système NucliSENS EasyMag bioMérieux, Marcy l’Etoile, France La détection des pathogènes a été réalisée à l’aide d’un test génomique TaqMan utilisant le système de PCR rapide en temps réel AB Applied Biosystems, San Francisco , Californie Les tests commencent par une paire de tests de réactions mono-critères pour les cibles IS et ptxS IS est la séquence d’insertion la plus fréquente dans B pertussis, avec plusieurs copies par génome, ce qui en fait une cible très sensible Par contraste, ptxS, codant pour la toxine coquelucheuse, existe généralement sous forme de copie unique ou occasionnelle, ce qui rend le ptxS hautement spécifique mais moins sensible Parce que ces amorces / sondes ont des températures de recuit différentes, elles sont parallèles sur des plaques séparées. était positif, l’ADN a été réextrait et une réaction de PCR multiplex a été répétée pour les tests de IS et de ptxS, et maintenant avec des amorces / sondes spécifiques à Bordetella parapertussis PIS et Bo rdetella holmesii HIS Toutes les amorces et sondes ont été achetées chez Life Sciences Solutions, une filiale de Fisher Biosciences. Cet article ne fournit que des résultats pour les réactions de B pertussis.Peudo-éclosions de coqueluche dues à une contamination accidentelle des écouvillons NP au moment de la collecte ou ultérieurement en laboratoire. , ont été rapportés fréquemment ces dernières années La principale cause de contamination est la collecte d’échantillons due ironiquement aux vaccins anticoquelucheux. Tous les vaccins anti-VIH utilisés dans le monde comprennent l’ADN de la coqueluche, tout comme le premier vaccin multivalent américain Pentacel Sanofi Pasteur Pour minimiser la contamination de nos prélèvements de NP pendant la collecte, notre clinique n’a stocké ni administré aucun vaccin. Pour les nourrissons ayant besoin de vaccinations de routine, celles-ci ont été administrées seulement après que toutes les données d’étude et les prélèvements d’échantillons ont été complétés. notre clinique, accessible par une entrée séparée du bâtiment Pour exclure les contaminants En laboratoire, tous les essais de PCR comprenaient un contrôle positif et négatif, le premier confirmant la réussite de la réaction de PCR et générant des résultats cohérents à travers les essais, le second pour dépister les contaminations environnementales au sein du laboratoire. chaque échantillon de patient a été testé avec une amorce / sonde contre le gène humain RNAse P Son produit est une enzyme constitutive sécrétée par toutes les cellules humaines, et par conséquent teste si l’écouvillon a fait un contact efficace avec la muqueuse respiratoire

Hypothèses de taille de l’échantillon

PERCH était une étude épidémiologique de la pneumonie pédiatrique sévère, qui comprenait le site de Lusaka, en Zambie, PERCH était une étude de cas-témoins en milieu hospitalier. et défini ses « cas » comme des enfants, âgés de ≥ semaines, présentant un syndrome clinique compatible avec une pneumonie sévère ou très sévère selon les critères de l ‘Organisation Mondiale de la Santé De ces critères, les enfants PERCH étaient âgés de plusieurs mois et donc proches des estimations SAMIPS. Nous avons observé que la coqueluche représentait à peu près le% de la pneumonie sévère chez les nourrissons de Lusaka – mois. Nous avons extrapolé les taux à partir de ces données afin d ‘estimer le nombre de cas de pneumonie grave. l’incidence de la population dans la catégorie d’âge pertinente pour SAMIPS en utilisant les hypothèses suivantes: D’une cohorte d’environ grossièrement admis à Lusak Chaque année, environ% présentaient une pneumonie sévère ou très sévère. Si ces données étaient typiques, environ% des enfants âgés de 1 mois avec une pneumonie sévère ou très sévère avérée coqueluche représentent environ% de tous les enfants admis au CHU par an, soit environ Considéré comme un taux et en supposant une incidence égale par mois, cela a donné une incidence d’environ cas par mois-nourrisson. Comme il s’agissait d’une étude transversale hospitalière, et non d’une véritable enquête de population, nous avons adopté une Par conséquent, en prenant plutôt un taux de coqueluche des cas par nourrisson par mois comme limite d’incidence plausible plus faible, avec une marge d’erreur de ±% comme la largeur de l’intervalle de confiance désiré et en utilisant la formule de la taille de l’échantillon pour une seule proportion: n = [degrés de liberté * Np-p] [d / Z-α / * N-p * -p], les sujets détecteraient cette incidence. mangeaient pour la coqueluche avec% de confiance En arrondissant, la taille de notre échantillon cible était les paires mère-nourrisson

Analyses statistiques

Nous avons défini les cas d’un nourrisson présentant l’un des signes ou symptômes de notre formulaire de dépistage avec un résultat PCR positif selon les critères CDC. Remarquez que ceci est distinct de la définition de cas de CDC utilisée dans la surveillance de routine aux Etats-Unis. des voies: si un nourrisson a une toux de toute durée avec une confirmation de culture microbiologique; Ce faisant, la définition du CDC augmente la spécificité de la détection tout en sacrifiant la sensibilité par rapport à notre définition de cas de dépistage. Avant le début de l’étude, dans les discussions avec le groupe scientifique consultatif, il a été décidé que la PCR était suffisamment convaincante si on suivait le protocole du CDC que nous étions. Par conséquent, les cultures n’étaient pas obtenues, ce qui signifiait qu’il n’y aurait aucun moyen de satisfaire la première voie. Nous notons que les nourrissons présentant ces symptômes seraient probablement classés comme «coqueluche grave» en utilisant l’échelle de Preziosi voir ci-dessous, en contradiction avec notre objectif de mesurer également la coqueluche non vénérienne

Pour nos calculs d’incidence, nous avons utilisé le temps-personne comme dénominateur, avec les nourrissons atteints de coqueluche symptomatique confirmée par PCR comme numérateurs. Les cas positifs ont également été classés comme coqueluche sévère / non sévère en utilisant le système de score de sévérité de la coqueluche développé par Monica Preziosi à l’OMS. ] L’échelle de Preziosi a été développée pour les enfants plus âgés, pas pour les nourrissons. Parce que les nourrissons peuvent présenter des symptômes différents de ceux des enfants plus âgés, nous avons créé une échelle de Preziosi à l’échelle modifiée pour les nourrissons. semaines d ‘âge La coqueluche symptomatique a été définie comme un résultat de PCR positif selon les critères du CDC en présence de l’ un de nos symptômes de dépistage. Nonsevere pertussis a été défini comme un score MPS de – points; sévère est & gt; Ce processus est résumé dans la figure. La MPS est incluse dans le tableau supplémentaire. Voir la diapositive grand téléchargementRelation entre la population totale de nourrissons, la population symptomatique et ceux qui ont une réaction en chaîne de la polymérase et la façon dont ils ont été triés par gravité en utilisant l’échelle de Preziosi modifiée. MPSFigure View largeDownload slideRelationship entre la population infantile totale, la population symptomatique, et ceux avec la réaction en chaîne de la polymérase coqueluche confirmée par PCR et comment ceux-ci ont été triés par gravité en utilisant l’échelle de Preziosi modifiée MPS

La population inscrite comprenait ceux qui avaient au moins une visite de base et un prélèvement de NP Aucune imputation n’a été effectuée pour les données manquantes. Dans les résumés, les données manquantes n’ont pas contribué aux dénominateurs en moyennes et pourcentages. les critères d’évaluation suivants ont été calculés: le taux d’incidence de la coqueluche et de la coqueluche sévère et non définie séparément, divisé par le nombre total de personnes par mois. Dans les analyses stratifiées, nous avons calculé la contribution des caractéristiques maternelles et infantiles aux mesures susmentionnées. En outre, nous avons calculé l’incidence en fonction du nombre de doses vaccinales pentavalentes administrées avant l’apparition des symptômes. Pour cette dernière analyse seulement, nous avons défini les cas comme se produisant « postvaccination » s’ils au moins plusieurs semaines après la dernière vaccination, ce qui laisse suffisamment de temps pour le nourrisson a monté une réponse immunitaire Toutes les manipulations de données et statistiques ont été effectuées en utilisant le logiciel SAS, version SAS Institute, Cary, Caroline du Nord

RÉSULTATS

Étant donné que le personnel de la clinique n’a pas examiné systématiquement si la toux avait été signalée lors de la visite précédente, il n’a pas enregistré les symptômes de toux signalés précédemment. En d’autres termes, nos procédures ont systématiquement détecté la toux à gauche d’un test de PCR. sur cette figure, mais pas à droite de la PCR dans cette analyse de séries temporelles. Avec cette mise en garde, plusieurs observations peuvent être faites. Premièrement, les nourrissons sont souvent testés positifs pour la coqueluche par PCR plusieurs fois au cours du temps Deuxièmement, en supposant que la toux peut être continue entre les lacunes de nos données, la durée de la toux était assez longue dans plusieurs cas. Plusieurs nourrissons avaient des durées de toux d’au moins – jours, et pendant au moins jours. Cependant, un certain nombre de nourrissons avaient seulement quelques jours de toux. coryza et aucun antécédent d’identification de sujet de la toux – lors de cette visite ou de toute visite subséquente Une toux grave, signalée par les mères, est survenue seulement deux fois, y compris le nourrisson atteint de coqueluche sévère. eDownload slide Relation temporelle entre les jours de toux précédant une visite où la réaction en chaîne de la polymérase PCR sur le prélèvement rhinopharyngé était sans équivoque positive selon les critères de Ct, seuil de cycle Chaque rangée correspond aux nourrissons atteints de coqueluche identifiés dans le sud. Étude sur la coqueluche infantile en Afrique mère Les résultats sont alignés sur le premier jour étant le premier jour de toux signalé pour ce nourrisson; Tous les jours suivants de toux et les résultats de PCR sont relatifs à ce premier jour de toux Ils sont sur une échelle absolue, et ne reflètent donc pas le temps du calendrier, ce qui signifie que ces événements ne se chevauchent pas nécessairement dans le temps. était une constatation commune parmi ces cas, qui a conduit à plusieurs PCR obtenues au fil du temps, et de multiples réactions positives sur les individus. En théorie, les visites devaient être espacées de plusieurs jours, mais les mères ne suivaient pas nécessairement ce calendrier. conçu pour suivre la toux prospectivement jusqu’à la résolution Plutôt, si un enfant présentait de la toux lors d’une visite donnée, la durée de la toux avant la visite était enregistrée. Pour cette raison, la toux ne semble pas s’étendre au droit des visites positives à la PCR. il s’agit simplement d’un artefact du système de collecte de données. De même, les jours de toux étaient tels que rapportés par les mères et ne pouvaient pas être vérifiés de manière indépendante. Cela peut expliquer certains Par exemple, le sujet – semble avoir eu un écart d’un jour entre une PCR positive et la reprise de la toux Ceci est probablement dû à un rappel imparfait de la durée de la touxFigure View largeTélécharger une diapositiveRelation temporelle entre les jours de toux précédant une visite dans laquelle la réaction en chaîne de la polymérase Le résultat de la PCR sur le prélèvement rhinopharyngé était sans équivoque positif selon les critères du Centre de contrôle et de prévention des maladies Ct, seuil de cycle Chaque rangée correspond aux nourrissons atteints de coqueluche identifiés dans l’étude sur la coqueluche infantile en Afrique australe. étant le premier jour de toux signalé pour ce nourrisson; Tous les jours suivants de toux et les résultats de PCR sont relatifs à ce premier jour de toux Ils sont sur une échelle absolue, et ne reflètent donc pas le temps du calendrier, ce qui signifie que ces événements ne se chevauchent pas nécessairement dans le temps. était une constatation commune parmi ces cas, qui a conduit à plusieurs PCR obtenues au fil du temps, et de multiples réactions positives sur les individus. En théorie, les visites devaient être espacées de plusieurs jours, mais les mères ne suivaient pas nécessairement ce calendrier. conçu pour suivre la toux prospectivement jusqu’à la résolution Plutôt, si un enfant présentait de la toux lors d’une visite donnée, la durée de la toux avant la visite était enregistrée. Pour cette raison, la toux ne semble pas s’étendre au droit des visites positives à la PCR. il s’agit simplement d’un artefact du système de collecte de données. De même, les jours de toux étaient tels que rapportés par les mères et ne pouvaient pas être vérifiés de manière indépendante. Cela peut expliquer certains Par exemple, le sujet semble avoir eu un écart d’un jour entre une PCR positive et la reprise de la toux Ceci est probablement dû à un rappel imparfait de la durée de la toux. Dix enfants sont morts pendant l’étude, tous en raison d’une septicémie présumée et / ou infections respiratoires aiguës Comme analyse post hoc, nous avons testé tous les échantillons de NP de ces nourrissons et de leurs mères qui avaient été obtenus avant l’événement terminal Aucun de ces échantillons testés positifs pour la coqueluche Cependant, cela ne peut exclure absolument la coqueluche comme cause de la mort, comme tout cela montre que lors de la visite la plus récente, ils n’avaient pas de coqueluche Deux nourrissons ont été hospitalisés avec des conditions non fatales de distension abdominale et des vomissements dans l’un; fièvre et diarrhée dans le second Aucun des deux n’avait de cause respiratoire pour l’hospitalisation et n’a pas subi d’échantillonnage NP lors de ces occasions

DISCUSSION

Des estimations plus robustes pourraient être obtenues en augmentant la surveillance sur des cycles pluriannuels pour tenir compte de ces fluctuations. En accord avec d’autres études, nous avons observé une forte prédominance féminine chez les nourrissons atteints de coqueluche Des études antérieures ont été équivoques sur la relation Ici, le VIH maternel a semblé augmenter modestement l’incidence infantile, bien qu’il n’ait pas atteint la signification statistique. Seule la mère avait un nombre récent de CD, excluant les inférences sur l’impact de divers degrés d’immunodéficience. Les résultats les plus intéressants étaient que% des cas de coqueluche infantile étaient non évidents, se présentant avec les symptômes non spécifiques de la toux et de la coryza. Une question raisonnable est alors pourquoi ces données entrent en conflit avec les descriptions cliniques antérieures de la coqueluche chez les nourrissons. possibilité que nous devrions reconnaissent que ces résultats pourraient être faussement positifs Ceci pourrait être dû à la contamination des échantillons pendant la collecte ou durant les tests lui-même Cependant, notre utilisation de procédures strictes de contrôle de qualité aurait dû minimiser ce potentiel. Une autre possibilité est la fausse attribution de B pertussis comme cause des symptômes si le nourrisson était simultanément infecté par un autre agent pathogène, tel qu’un virus respiratoire, qui était en fait responsable des symptômes. Cela étant dit, cette question de fausse attribution serait beaucoup plus difficile à analyser si cela avait été une analyse transversale. analyse Ici, la structure longitudinale de nos données, avec les nourrissons présentant une toux prolongée et / ou coryza avec de multiples résultats PCR positifs au fil du temps, fournit un niveau de preuve supplémentaire soutenant notre hypothèse qu’il s’agissait de véritables cas de coqueluche non Le Pakistan, suivant une conception de cohorte longitudinale sensiblement similaire à la nôtre, a atteint Si nous acceptons que les résultats ne sont probablement pas dus à des faux positifs ou à une fausse attribution, une autre explication plausible de la symptomatologie inhabituelle est le biais de constatation. Cela concerne la façon dont nous avons sélectionné les échantillons pour les tester par rapport à En général, les directives de dépistage du CDC recommandent de tester la coqueluche si un enfant présente ≥ une semaine de toux accompagnée d’une coqueluche et / ou d’apnée, d’une cyanose ou de vomissements post-traumatiques, une constellation de symptômes qui répond aux besoins. définition de «coqueluche sévère» sur l’échelle de Preziosi Les critères CDC visent à maximiser le rapport signal sur bruit, c’est-à-dire à maximiser la spécificité au détriment de la sensibilité lorsqu’il est utilisé pour la surveillance de routine des maladies. il a la conséquence involontaire d’introduire une circularité logique: en testant uniquement les individus qui sont Par définition, la coqueluche est sévère. Cette approche du dépistage répond à la question épidémiologique suivante: «Quelle proportion des nourrissons qui ont l’air de souffrir de coqueluche grave ont-ils réellement une coqueluche grave? une question fondamentalement différente de «Quelle proportion de nourrissons atteints de coqueluche a ou développera une coqueluche sévère» Et parce que le spectre complet des présentations de la maladie n’a pas été évalué systématiquement et longitudinalement SAMIPS a été conçu pour identifier les cas dans toute la gamme de gravité et d’observer l’évolution des symptômes au fil du temps Nous avons testé au premier signe de symptômes respiratoires, par conséquent,% de nos cas ont eu des durées de toux & lt; Mais l’avantage de cette approche est qu’elle nous a également permis d’observer la proportion qui a développé plus tard une maladie grave et aurait vraisemblablement été le type d’individus détectés selon les directives de la CDC. En conclusion, la coqueluche était prévalente dans cette population de nourrissons zambiens. Cependant, de tels cas éludent systématiquement le diagnostic clinique car ils ne présentent pas les symptômes classiques généralement associés à la coqueluche chez les nourrissons et les enfants. La prépondérance de la maladie bénigne identifiée ici semble contredire les rapports antérieurs que les nourrissons coquelucheux sont généralement sévères, mais cela est certainement un artefact de biais de détermination dans la sélection des échantillons pour les tests et l’absence de fardeau longitudinal longitudinal des études de surveillance des maladies. nécessaire pour clarifier l’impact de la maternité Statut VIH chez la coqueluche infantile Le regroupement des cas de coqueluche au cours des premiers mois avant qu’une immunité efficace contre la vaccination des nourrissons puisse raisonnablement être atteinte soutient la justification d’une stratégie de vaccination maternelle par le dcaT.

Remarques

Remerciements Nous reconnaissons les contributions importantes des personnes suivantes: Angela Lyondo était la responsable des échantillons de laboratoire; La beauté Matoka, Florence Aikayo, Florence Chilaisha, et Gladys Lungu étaient les infirmiers SAMIPS de l’Afrique australe mère Coqueluche étude; Benard Wayne Ngoma et Roy Aikayo étaient les agents cliniques du SAMIPS; Sam Mwanza était le technologue en PCR de la réaction en chaîne de la polymérase; Carol Buumba Masempela, Peggy Mwambazi, Theresa Banda et Florence Mumba étaient notre équipe de sensibilisation communautaire, plus Ian Moonga qui était aussi notre exemple de messagerie; Kelley Ambrose était notre stagiaire du Centre pour la santé mondiale et le développement; Kenya Nous étions reconnaissants pour le soutien de Mme Lillian Chomba et de Mme Mutinta Chinkuli, la Directrice et responsable de Chawama SSP respectivement, et leur équipe d’infirmières cliniques talentueuses: Nous remercions également Godfrey Biemba, directeur scientifique du ZCAHRD, et David Kalaba, directeur des finances et de l’administration de ZCAHRD, qui ont tous deux contribué à faire de ce projet un succès. était le chercheur principal PI sur SAMIPS, a sécurisé le financement, développé le protocole, supervisé la conduite et l’analyse de l’étude, et dirigé la rédaction du manuscrit LM était le PI zambien pour SAMIPS Il a supervisé tous les aspects de la mise en œuvre de l’étude en Zambie dans le développement du protocole, analyse de l’étude, et a été étroitement impliqué dans l’analyse et la déclaration des données WM était le statisticien pour SAMIP S Il a développé le plan d’analyse statistique, supervisé la saisie et le nettoyage des données, effectué les analyses statistiques finales et a été étroitement impliqué dans l’analyse et le reporting des données GK a dirigé le laboratoire de PCR pour SAMIPS Il a supervisé tous les aspects de la gestion des échantillons Il a mis au point les derniers protocoles d’exploitation standard et a été étroitement impliqué dans l’analyse et la communication des données. MM a été le chef d’équipe sur le terrain en Zambie. Elle a supervisé tous les aspects de l’inscription des sujets, la saisie des données et la collecte des échantillons. AL était le chef de projet basé à Boston sur SAMIPS. Elle a travaillé en étroite collaboration avec CG sur tous les aspects de la gestion des études, de la supervision financière et de la vérification interne. réunions d’étude, contrôlé le diagramme de Gantt, et effectué des visites de terrain. Elle a été étroitement impliquée dans l’analyse et la les données KS était le gestionnaire de données sur le terrain Il a fourni un soutien technique au système de stylo numérique Xcallibre, a assuré le contrôle de la qualité de la saisie des données, et a effectué une grande partie du nettoyage des données. Senior Data Manager Elle a supervisé tous les aspects de la génération de requêtes de données, résumé les métriques d’étude pour aider à la gestion du projet, a soutenu WM sur les analyses et a été étroitement impliquée dans l’analyse et le reporting des données. Laboratoire de PCR à Lusaka, et a travaillé en étroite collaboration avec GK pour assurer le contrôle qualité des processus de test. Il a été étroitement impliqué dans l’analyse et le reporting des données. DT a été le conseiller technique senior de l’étude. tous les aspects de la conception et de la supervision des études, et a été étroitement impliqué dans l’analyse et la présentation des données. Le soutien financier pour le SAMIPS a été fourni e Bill & amp; Melinda Gates FoundationSupplément parrainage Cet article apparaît dans le cadre du supplément « Fardeau de la maladie de la coqueluche infantile dans le contexte des stratégies de vaccination maternelle », parrainé par le projet de loi & amp; Fondation Melinda Gates Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit rapporté Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués