Les chercheurs de la Mayo Clinic combinent des variantes génétiques communes et d’autres facteurs pour améliorer la prédiction du risque de cancer du sein

ROCHESTER, Minnesota – Des analyses génomiques récentes à grande échelle ont mis au jour des douzaines de variantes génétiques communes associées au cancer du sein. Chaque variante, cependant, contribue seulement une petite quantité au risque global d’une personne de développer la maladie.

Une équipe de chercheurs internationaux dirigée par la Mayo Clinic a maintenant combiné 77 de ces variantes génétiques communes en un seul facteur de risque qui peut être utilisé pour améliorer l’identification des femmes ayant un risque élevé de cancer du sein. Ce facteur, connu sous le nom de score de risque polygénique, a été construit à partir des données génétiques de plus de 67 000 femmes. Les résultats de la recherche sont publiés le 2 avril 2015 dans le Journal de l’Institut national du cancer (JNCI).

Une étude complémentaire a prolongé cette découverte pour montrer que cette mesure de la variation génétique peut être combinée avec des prédicteurs traditionnels du risque de cancer du sein tels que la densité mammaire et les antécédents familiaux pour améliorer les estimations personnalisées du risque de cancer du sein arthropathie. Ces résultats sont apparus dans JNCI le mois dernier: «Ce facteur de risque génétique ajoute des informations précieuses à ce que nous savons déjà peut affecter les chances d’une femme de développer un cancer du sein», explique Celine Vachon, Ph.D., épidémiologiste à la Mayo Clinic . « Nous développons actuellement un test basé sur ces résultats, et bien qu’il ne soit pas encore prêt pour une utilisation clinique, je pense que dans les prochaines années nous utiliserons cette approche pour de meilleures stratégies de dépistage et de prévention personnalisées pour nos patients. »

Les scientifiques savent depuis des décennies que la génétique peut jouer un rôle dans le cancer du sein. Par exemple, l’hérédité d’une mutation dans les gènes BRCA1 et BRCA2 augmente considérablement le risque de développer la maladie chez la femme, mais ces mutations sont rares et représentent moins de cinq pour cent de tous les cancers du sein. Des variations génétiques plus courantes connues sous le nom de polymorphismes mononucléotidiques ou SNP contribuent également à la prédisposition au cancer, mais les contributions individuelles sont trop faibles pour prédire le risque de cancer du sein.

Dans cette étude, les chercheurs ont testé s’ils pouvaient combiner les effets de ces SNP individuels dans un seul facteur de risque de cancer du sein. Les investigateurs ont essentiellement additionné des informations sur 77 SNP de 33 673 patients atteints de cancer du sein et de 33 381 sujets sains pour obtenir le score de risque polygénique.

Ils ont montré que le score de risque polygénique pouvait réussir à placer les femmes dans différentes catégories de risques. Comparativement aux femmes ayant un score de risque polygénique moyen, les femmes parmi les 1% les plus à risque étaient trois fois plus susceptibles de développer un cancer du sein. De plus, les femmes qui se situaient au plus bas pourcentage du score avaient 70% moins de risques de développer un cancer du sein. Ces résultats indiquent que le score de risque polygénique est aussi puissant que d’autres facteurs de risque connus tels que la densité mammaire ou les antécédents familiaux.

«Pour faire un meilleur prédiction des risques, nous devons inclure ce profil génétique dans les modèles de risque de cancer du sein, ainsi que d’autres informations pertinentes comme les antécédents familiaux, les facteurs de risque de style de vie, les biopsies antérieures et la densité mammaire». Fergus Couch, Ph.D., un généticien moléculaire et pathologiste à la Mayo Clinic. « Mais nous devons d’abord nous assurer que chacun des facteurs est indépendant, car si le score de risque polygénique ne fait que répéter ce qui était déjà pris en compte par certains des autres facteurs de risque connus, il ne sera pas utile dans un modèle de risque. « 

Drs. Couch et Vachon ont mené une deuxième étude pour évaluer le chevauchement entre le score de risque polygénique et le système de rapports et de données sur l’imagerie du sein (BI-RADS), une mesure de la densité mammaire qui est évaluée régulièrement en milieu clinique. À l’aide des données de trois études cliniques portant sur 1 643 patientes atteintes du cancer du sein et sur 2 397 sujets en bonne santé, les chercheurs ont constaté que les deux facteurs contribuent de façon indépendante à l’information sur le risque de cancer du sein.

Ils ont incorporé le score de risque polygénique dans le modèle de prédiction du risque du cancer du sein, qui utilise la densité mammaire, les antécédents familiaux de cancer du sein, les antécédents de biopsie mammaire, l’âge et l’origine ethnique pour calculer le risque de cancer du sein. Les chercheurs ont ensuite comparé la prédiction du risque à cinq ans calculée en utilisant le modèle BCSC avec et sans l’information génétique. L’ajout du score de risque polygénique a amélioré la performance du modèle, aidant à placer 11% des femmes qui ont fini par avoir le cancer dans une catégorie de risque plus élevée où elles auraient pu bénéficier d’interventions telles que IRM, chimioprévention ou même mastectomie prophylactique. .

Les résultats suggèrent que la densité mammaire et la variation génétique commune sont importantes pour la prédiction du risque et devraient être incluses dans les modèles cliniques. Cependant, les chercheurs disent que des études plus importantes sont encore nécessaires pour tester la capacité de ces modèles à estimer le risque dans la population générale.

«Il y a eu beaucoup de variantes génétiques communes associées aux cancers, non seulement pour le cancer du sein, mais aussi pour le cancer de l’ovaire et la prostate, mais jusqu’à présent nous n’avons pas vu ces variantes en pratique clinique», explique le Dr Vachon. « À l’avenir, ces facteurs seront utiles pour déterminer qui est le plus à risque et le plus faible risque de cancer et aider les patients et les cliniciens à prendre de meilleures décisions au sujet de leurs soins. »

L’étude a été financée par le National Cancer Institute et la Breast Cancer Research Foundation.

PERSONNE-RESSOURCE: Joe Dangor, Affaires publiques de la clinique Mayo, 507-284-5005, newsbureau@mayo.edu

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